YANG-MING INSTITUTE OF BIOMEDICAL INFORMATICS
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授課系級 生醫資所碩士班、生物資訊學程
碩博士班生資專討上傳系統 http://video.ym.edu.tw/

※各項規定以各班授課老師要求為主

[生資碩士班] 1052[生醫資專討(碩班生資I)]
Instructors 林振慶老師、王禹超老師
Location 圖資大樓403教室 (Rm. 403, Library, Information, and Research Building)
Time Monday,13:20-15:10
Website http://video.ym.edu.tw/course/view.php?id=161
1052[生醫資專討(碩班生資I)]-規定
Date Speaker Topic Note
02月13日 - 開學第一週
02月20日 -
02月27日 - 二二八彈性放假
03月06日 A Mapping the effects of drugs on the immune system paper
03月13日 B Mapping the effects of drugs on the immune system discussion
03月20日 B A Network of Conserved Synthetic Lethal Interactions for Exploration of Precision Cancer Therapy paper
03月27日 A A Network of Conserved Synthetic Lethal Interactions for Exploration of Precision Cancer Therapy discussion
04月03日 - 清明節彈性放假
04月10日 - 期中考週
04月17日 - 請同學參加碩二總評量
04月24日 B Causal Mechanistic Regulatory Network for Glioblastoma Deciphered Using Systems Genetics Network Analysis paper
05月01日 A Causal Mechanistic Regulatory Network for Glioblastoma Deciphered Using Systems Genetics Network Analysis discussion
05月08日 -
05月15日 A Early and multiple origins of metastatic lineages within primary tumors paper
05月22日 -
05月29日 - 端午節彈性放假
06月05日 B Early and multiple origins of metastatic lineages within primary tumors discussion
06月12日 - 期末考週

分組名單:A組 (許眾棠、林宣辰、吳宜庭、葉大瑋)、B組 (蔡宗軒、倪崇恩、方煒甯、葉紓Q)


[生資碩士班] 1052[生醫資專討(碩班生資II)]
Instructors 黃彥華老師、楊永正老師、鍾翊方老師
Location 圖資大樓411教室 (Rm. 411, Library, Information, and Research Building)
Time Monday,13:20-15:10
Website http://video.ym.edu.tw/course/view.php?id=162
1052[生醫資專討(碩班生資II)]-規定
Date Speaker Topic Note
02月13日 - 開學第一週
02月20日 - -
02月27日 - 二二八彈性放假
03月06日 施皓軒 A machine learning approach for the identification of key markers involved in brain development from single-cell transcriptomic data
03月13日 林亞柔 Dual RNA-seq reveals viral infections in asthmatic children without respiratory illness which are associated with changes in the airway transcriptome
03月20日 謝馥媺 An analytical workflow for accurate variant discovery in highly divergent regions
03月27日 - -
04月03日 - 清明節彈性放假
04月10日 - 期中考週
04月17日 - 請同學參加碩二總評量
04月24日 鄭博營 Prediction of drugs having opposite effects on disease genes in a directed network
05月01日 張郁琳 Pancancer modelling predicts the context-specific impact of somatic mutations on transcriptional programs
05月08日 王琳翔 Fast motif matching revisited high-order PWMs, SNPs and indels
05月15日 施皓軒 Building a genetic risk model for bipolar disorder from genome-wide association data with random forest algorithm
林亞柔 Huntington’s disease blood and brain show a common gene expression pattern and share an immune signature with Alzheimer’s disease
05月22日 - -
05月29日 - 端午節彈性放假
06月05日 謝馥媺 Detailed simulation of cancer exome sequencing data reveals differences and common limitations of variant callers
鄭博營 Disentangling genetic and environmental risk factors for individual diseases from multiplex comorbidity networks
06月12日 張郁琳
王琳翔

[醫資碩士班] 1052[生醫資專討(醫資碩博)]
Instructors 張博論老師、巫坤品老師
Location 圖資大樓402教室 (Rm. 402, Library, Information, and Research Building)
Time Monday,13:20-15:10
Website/
Information
Seminar on Big Data for Health
Special Issue of JBHI
http://jbhi.embs.org/2015/07/08/special-issue-big-data-for-health/

Articles in this Special Issue

  • Big data for health – Andreu Perez et al
  • Big data, big knowledge: big data for personalised healthcare – Viceconti et al
  • Predicting Days in Hospital Using Health Insurance Claims – Xie et al
  • Predicting Asthma-Related Emergency Department Visits Using Big Data – Ram et al
  • Hierarchical Classification of Large-Scale Patient Records for Automatic Treatment Stratification – Mei et al
  • We Feel: Mapping emotion on Twitter – Larsen et al
  • Symmetrical Compression Distance for Arrhythmia Discrimination in Cloud-based Big Data Services – Lillo-Castellano et al
  • Optimal Drug Prediction from Personal Genomics Profiles – Sheng et al
  • Toward Non-invasive Quantification of Brain Radioligand Binding by Combining Electronic Health Records and Dynamic PET Imaging Data – Mikhno et al
  • Big Heart Data: Advancing Health Informatics through Data Sharing in Cardiovascular Imaging – Suinesiaputra et al

Grading:Participation 40%, Presentation 40%, Term Project (<5 pages, by IMRDC Review structure) 20%.

Date Speaker Topic Note
02月13日 課程第一天上課,公佈醫資組碩博專討報告方式及順序
02月20日 -
02月27日 - 二二八彈性放假
03月06日 沈欣玫
黃曼伶
鄭啟桐
Predicting Days in Hospital Using Health Insurance Claims – Xie et al
03月13日 -
03月20日 - 臨時停課
03月27日 -
04月03日 - 清明節彈性放假
04月10日 鄭柏吟
江鳳
張又升
Predicting Asthma-Related Emergency Department Visits Using Big Data – Ram et al
04月17日 - 請同學參加碩二總評量
04月24日 葉欣澔
葉皓暐
王育嬰
Hierarchical Classification of Large-Scale Patient Records for Automatic Treatment Stratification – Mei et al
05月01日 -
05月08日 李勁緯
簡群恩
黃弘毅
We Feel: Mapping emotion on Twitter – Larsen et al
05月15日 施丞洋
張詠銓
蔡政霖
Symmetrical Compression Distance for Arrhythmia Discrimination in Cloud-based Big Data Services – Lillo-Castellano et al 補課(補3/20)
05月22日 -
05月29日 - 端午節彈性放假,6/3(六)補課
06月03日 邱彥榕
林宗毅
潘昭宇
Optimal Drug Prediction from Personal Genomics Profiles – Sheng et al 補課(補6/5,一次上兩堂)
陳雅玲
黃俊諺
李祥豪
Toward Non-invasive Quantification of Brain Radioligand Binding by Combining Electronic Health Records and Dynamic PET Imaging Data – Mikhno et al
06月05日 - 停課
06月12日 - 期中考週