105學年度下學期生醫資訊專題討論(碩士班) | 國立陽明交通大學生物醫學資訊研究所

YANG MING CHIAO TUNG INSTITUTE OF BIOMEDICAL INFORMATICS

碩士班
授課系級	生醫資所碩士班、生物資訊學程
碩博士班生資專討上傳系統	http://video.ym.edu.tw/

※各項規定以各班授課老師要求為主

[生資碩士班]	1052[生醫資專討(碩班生資I)]
Instructors	林振慶老師、王禹超老師
Location	圖資大樓403教室 (Rm. 403, Library, Information, and Research Building)
Time	Monday,13:20-15:10
Website	http://video.ym.edu.tw/course/view.php?id=161
	1052[生醫資專討(碩班生資I)]-規定

Date	Speaker	Topic	Note
02月13日	-	開學第一週
02月20日	-
02月27日	-	二二八彈性放假
03月06日	A	Mapping the effects of drugs on the immune system	paper
03月13日	B	Mapping the effects of drugs on the immune system	discussion
03月20日	B	A Network of Conserved Synthetic Lethal Interactions for Exploration of Precision Cancer Therapy	paper
03月27日	A	A Network of Conserved Synthetic Lethal Interactions for Exploration of Precision Cancer Therapy	discussion
04月03日	-	清明節彈性放假
04月10日	-	期中考週
04月17日	-	請同學參加碩二總評量
04月24日	B	Causal Mechanistic Regulatory Network for Glioblastoma Deciphered Using Systems Genetics Network Analysis	paper
05月01日	A	Causal Mechanistic Regulatory Network for Glioblastoma Deciphered Using Systems Genetics Network Analysis	discussion
05月08日	-
05月15日	A	Early and multiple origins of metastatic lineages within primary tumors	paper
05月22日	-
05月29日	-	端午節彈性放假
06月05日	B	Early and multiple origins of metastatic lineages within primary tumors	discussion
06月12日	-	期末考週

分組名單：A組 (許眾棠、林宣辰、吳宜庭、葉大瑋)、B組 (蔡宗軒、倪崇恩、方煒甯、葉紓彣)


[生資碩士班]	1052[生醫資專討(碩班生資II)]
Instructors	黃彥華老師、楊永正老師、鍾翊方老師
Location	圖資大樓411教室 (Rm. 411, Library, Information, and Research Building)
Time	Monday,13:20-15:10
Website	http://video.ym.edu.tw/course/view.php?id=162
	1052[生醫資專討(碩班生資II)]-規定

Date	Speaker	Topic
02月13日	-	開學第一週
02月20日	-	-
02月27日	-	二二八彈性放假
03月06日	施皓軒	A machine learning approach for the identification of key markers involved in brain development from single-cell transcriptomic data
03月13日	林亞柔	Dual RNA-seq reveals viral infections in asthmatic children without respiratory illness which are associated with changes in the airway transcriptome
03月20日	謝馥媺	An analytical workflow for accurate variant discovery in highly divergent regions
03月27日	-	-
04月03日	-	清明節彈性放假
04月10日	-	期中考週
04月17日	-	請同學參加碩二總評量
04月24日	鄭博營	Prediction of drugs having opposite effects on disease genes in a directed network
05月01日	張郁琳	Pancancer modelling predicts the context-specific impact of somatic mutations on transcriptional programs
05月08日	王琳翔	Fast motif matching revisited high-order PWMs, SNPs and indels
05月15日	施皓軒	Building a genetic risk model for bipolar disorder from genome-wide association data with random forest algorithm
05月15日	林亞柔	Huntington’s disease blood and brain show a common gene expression pattern and share an immune signature with Alzheimer’s disease
05月22日	-	-
05月29日	-	端午節彈性放假
06月05日	謝馥媺	Detailed simulation of cancer exome sequencing data reveals differences and common limitations of variant callers
06月05日	鄭博營	Disentangling genetic and environmental risk factors for individual diseases from multiplex comorbidity networks
06月12日	張郁琳
06月12日	王琳翔


[醫資碩士班]	1052[生醫資專討(醫資碩博)]
Instructors	張博論老師、巫坤品老師
Location	圖資大樓402教室 (Rm. 402, Library, Information, and Research Building)
Time	Monday,13:20-15:10
Website/ Information	Seminar on Big Data for Health Special Issue of JBHI http://jbhi.embs.org/2015/07/08/special-issue-big-data-for-health/ Articles in this Special Issue Big data for health – Andreu Perez et al Big data, big knowledge: big data for personalised healthcare – Viceconti et al Predicting Days in Hospital Using Health Insurance Claims – Xie et al Predicting Asthma-Related Emergency Department Visits Using Big Data – Ram et al Hierarchical Classification of Large-Scale Patient Records for Automatic Treatment Stratification – Mei et al We Feel: Mapping emotion on Twitter – Larsen et al Symmetrical Compression Distance for Arrhythmia Discrimination in Cloud-based Big Data Services – Lillo-Castellano et al Optimal Drug Prediction from Personal Genomics Profiles – Sheng et al Toward Non-invasive Quantification of Brain Radioligand Binding by Combining Electronic Health Records and Dynamic PET Imaging Data – Mikhno et al Big Heart Data: Advancing Health Informatics through Data Sharing in Cardiovascular Imaging – Suinesiaputra et al Grading:Participation 40%, Presentation 40%, Term Project (<5 pages, by IMRDC Review structure) 20%.

Date	Speaker	Topic	Note
02月13日		課程第一天上課，公佈醫資組碩博專討報告方式及順序
02月20日	-
02月27日	-	二二八彈性放假
03月06日	沈欣玫黃曼伶鄭啟桐	Predicting Days in Hospital Using Health Insurance Claims – Xie et al
03月13日	-
03月20日	-	臨時停課
03月27日	-
04月03日	-	清明節彈性放假
04月10日	鄭柏吟江鳳張又升	Predicting Asthma-Related Emergency Department Visits Using Big Data – Ram et al
04月17日	-	請同學參加碩二總評量
04月24日	葉欣澔葉皓暐王育嬰	Hierarchical Classification of Large-Scale Patient Records for Automatic Treatment Stratification – Mei et al
05月01日	-
05月08日	李勁緯簡群恩黃弘毅	We Feel: Mapping emotion on Twitter – Larsen et al
05月15日	施丞洋張詠銓蔡政霖	Symmetrical Compression Distance for Arrhythmia Discrimination in Cloud-based Big Data Services – Lillo-Castellano et al	補課（補3/20）
05月22日	-
05月29日	-	端午節彈性放假，6/3(六)補課
06月03日	邱彥榕林宗毅潘昭宇	Optimal Drug Prediction from Personal Genomics Profiles – Sheng et al	補課（補6/5，一次上兩堂）
06月03日	陳雅玲黃俊諺李祥豪	Toward Non-invasive Quantification of Brain Radioligand Binding by Combining Electronic Health Records and Dynamic PET Imaging Data – Mikhno et al	補課（補6/5，一次上兩堂）
06月05日	-	停課
06月12日	-	期中考週

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